Обзор технологий секвенирования
Преподаватель - Алина Мацвай
10.00-10.10 Сбор, знакомство, представление
10.10 -11.45 Лекция 1
Введение, история развития технологий
– От Менделя до секвенирования биомолекул
– Разработки Сенгера, Максама и Гилберта
• Технологии секвенирования
– Метод необратимых терминаторов – секвенирование по Сенгеру
– Недостатки технологий первого поколения
– Секвенирующие платформы второго поколения
– Технология Solexa (Illumina), принцип работы, особенности, специфические ошибки, линейка приборов
11.45-12.00 Перерыв
12.00-14.00 Полупроводниковое секвенирование – Ion Torrent, принцип работы, особенности, специфические ошибки
– Технология ДНК-наноболов – BGI/MGI, принцип работы, особенности, линейка приборов
– Недостатки технологий второго поколения
– Третье поколение технологий
– PacBio, принцип работы, особенности, линейка приборов
– ONT, принцип работы, особенности, линейка приборов, портативные устройства
– Три поколения технологий
14.00-15.00 Обеденный перерыв
15:00-16:30 Лекция 2
• Применение технологий высокопроизводительного секвенирования
– Полногеномное секвенирование de novo
– Полногеномное ресеквенирование
– Таргетное ресеквенирование
– Транскриптомика
– Эпигенетика
– Метагеномика
– Палеогеномика
16.30-16.45 Перерыв
16.45-18.00 Лекция 3
– Пробоподготовка