Памятка по филогенетике

Добрый день!

Памятка участника

Координаторы интенсива:

Ольга Стукалова: +7-964-703-04-04

Злата Полева: +7-914-673-64-27

По срочным вопросам звоните или пишите в Telegram/Watsapp

Учебные дни: 10-11 августа 2024 (суббота и воскресенье)
11 августа состоится итоговое тестирование по пройденному материалу
Занятия начинается с 10.00 (мск) и заканчиваются в 18.00 (мск)
Каждый день предусмотрен перерыв на обед – ориентировочное время с 14.00 до 15.00 (мск) и два небольших перерыва по 20 мин.
Все дни с Вами будут работать Teaching assistant и Техническая поддержка - они помогут настроить ПО, ответят на все ваши вопросы в ходе обучения.

Программа интенсива:

День 1
Введение в филогенетику:
Мы начнем с обзора основных понятий и методов в филогенетике.

Филогенетический анализ: зачем и когда он нужен, каким он бывает, какие результаты даёт
Шаги в филогенетическом анализе
Проблемы, возникающие при филогенетическом анализе
Примеры грамотного и не очень филогенетического анализа: посмотрим и обсудим
Где можно проводить филогенетический анализ
Где брать данные для филогенетического анализа

День 2
Мы продолжим практическим занятием: будем проводить филогенетический анализ и смотреть на результаты, обсуждать и решать возникающие проблемы.

Выбор программы подстать данным
Выравнивание данных
Выбор метода и модели
Выбор бутстреппа
Построение филогенетического дерева и его визуализация
Обсуждение результатов

Каждый участник может проконсультироваться после курса с лектором по вопросу анализа собственных данных: задать вопросы, получить поддержку.

Общая информация:

Что необходимо сделать к началу занятий:

Добавьтесь в Telegram-чат
Просим установить отдельным приложением Telegram на ноутбук/компьютер, все вопросы Вы будете задавать в этом чате, а мы делиться с Вами презентациями и полезными ссылками.
Установить на ноутбук следующие программы:

Внимание! Операционная система на ноутбуке/компьютере может быть любой, все программы кроссплатформенные.

UGENE — https://ugene.net/ru/
MEGA X или MEGA 11 — https://www.megasoftware.net/ (на главной странице это 11 версия, можно установить её, можно установить 10 — нажать на основной странице Older Version и выбрать 10, функционал примерно одинаковый)
FigTree — http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/

Проверить, что работают сайты:

Запись курса:

Весь курс мы предоставим Вам в записи. После каждого дня обучения будем присылать ссылку на запись. Также в чат ТГ мы дублируем все важные презентации и дополнительно их выложим на диск после курса.

Тестовое подключение для участников:

09 августа (пятница) с 17.00 до 18.00 (по мск) будет проходить тестовое подключение к платформе webinar.ru для онлайн слушателей. Ссылка будет опубликована в чате курса.