Анализ NGS данных (продвинутый курс)
Курс разработан для ученых и врачей, уже имеющих базовые представления об анализе данных секвенирования
(7 учебных дней)
Открыта предзапись!
2025 г.

После окончания курса выдаётся
удостоверение установленного образца
Лицензия № Л035−1 298−77/607 139 от 12.08.2022
Очно и Онлайн
Секвенирование стало одним из основных инструментов исследований в современной медицине, молекулярной биологии и биотехнологии. Для использования результатов секвенирования необходимо уметь анализировать и интерпретировать исходные данные.

Курс рассчитан на слушателей c небольшим опытом анализа данных секвенирования и базовым представлением об ОС Linux, языках Python и R и стандартных биоинформатических программах.

На занятиях будут подробно рассмотрены области применения секвенирования, программы и методы анализа данных, а также их алгоритмы и типичные ошибки, возникающие в процессе работы.
Актуальность
Преимущества курса
  • -1-
    Реальные кейсы
    Научитесь самостоятельно решать задачи. Для каждого занятия мы предоставим реальный кейс из практики.
  • -2-
    Сопровождение преподавателя
    Сможете вместе с преподавателем пройти весь путь по обработке данных, включая установку необходимых программ и настройку сервера.
  • -3-
    Углубленные знания
    Углубитесь в отдельные разделы анализа NGS-данных, узнаете алгоритмы работы программ, создадите собственные пайплайны, которые сможете забрать с собой и использовать в своей работе.
Преимущества курса
  • -1-
    Реальные кейсы
    Научитесь самостоятельно решать задачи. Для каждого занятия мы предоставим реальный кейс из практики.
  • -2-
    Сопровождение преподавателя
    Сможете вместе с преподавателем пройти весь путь по обработке данных, включая установку необходимых программ и настройку сервера.
  • -3-
    Углубленные знания
    Углубитесь в отдельные разделы анализа NGS-данных, создадите собственные пайплайны, которые сможете забрать с собой и использовать в своей работе.

Для чего нужен этот курс

Курс разработан для ученых и врачей, уже имеющих базовые представления об анализе данных секвенирования, а также знакомых с ОС Linux, языками Python и R, которые хотят углубиться в отдельные темы обработки NGS данных, а также научиться автоматизировать процесс их анализа. Основной упор сделан на практическую работу и алгоритмы работы различных программ анализа данных.
Цель курса - получение навыков самостоятельного создания автоматизированных пайплайнов для анализа NGS-данных.
Автоматизированные пайплайны анализа NGS данных
Продвинутые пайплайны
Написанные на курсе пайплайны (или полученные алгоритмы) будут содержать все необходимые команды и программы для полноценного анализа.
Использование пайплайнов
Полученные пайплайны или алгоритмы анализа вы сможете использовать в дальнейшем для решения ваших рабочих задач
1
2
3

Перечень навыков и знаний, которые важны для прохождения курса:


• Знание основ молекулярной биологии

• Представления о стандартных экспериментальных подходах работы с ДНК и РНК и постановке ПЦР

• Базовые представления о биоинформатических подходах, позволяющих работать с нуклеотидными последовательностями.

• Представление о структуре данных секвенирования следующего поколения (файлы в формате fasta, fastq, sam, vcf и т.п.)

• Базовое представление о командной строке Linux и о функционале языков Python и R


Для выполнения практических заданий вам понадобится компьютер с установленными Rstudio, ssh и sftp- клиентами и некоторыми дополнительными пакетами для обработки данных секвенирования.

ВАЖНО! При записи на курс вам будет необходимо пройти входное тестирование, которое позволит определить ваш уровень знаний в указанных областях. При успешном прохождении тестирования вы будете зачислены на курс. Если вы наберете недостаточно баллов, то мы предложим записаться на 3-х дневный интенсив по ОС Linux, языкам Python и R для обработки биологических данных, который поможет усвоить темы.
которые стремятся к развитию в своей области
аспиранты, студенты старших курсов
Сотрудники организаций
Врачи и ученые
Студенты
Аудитория курса
занятые в области молекулярной биологии и смежных направлениях
Программа курса
Мацвай Алина
Дейниченко Ксения
Баринов Алексей
Курс читают
Потапова Надежда
Исаев Сергей
Стоимость курса
Стоимость курса

Записаться на курс
для прохождения курса вам необходимо заполнить заявку на участие,
с вами свяжется менеджер
Заполняя форму, вы принимаете условия договора оферты и даете
согласие на обработку своих персональных данных в соответствии с политикой конфиденциальности
Остались вопросы?
Оставьте контакты и мы вам перезвоним. Или свяжитесь с нами по тел:
+7 (495) 135 12 40. Остались вопросы: info@pcr.news
Заполняя форму, вы принимаете условия договора оферты и даете
согласие на обработку своих персональных данных в соответствии с политикой конфиденциальности
Акционерное общество «Сайенс Медиа Проджектс»
Юр.адрес: 129085, г.Москва, вн.тер.г. муниципальный округ Останкинский, ул. Годовикова, д. 9, стр. 9, этаж 2, пом./ком. I/5
ОГРН: 1187746923220 ИНН: 7702451857 КПП: 771701001