Телефон: +7 (495) 135 12 40
Курс повышения квалификации, 20 часов
Введение в биоинформатику нанопорового секвенирования
После окончания курса выдаётся
удостоверение установленного образца
Лицензия № Л035−1 298−77/607 139 от 12.08.2022
ЗАПИСАТЬСЯ НА КУРС
  • С 22 по 26 июня

  • Онлайн формат

  • С 9:00 до 13:00, 5 дней
Актуальность
Нанопоровое секвенирование быстро расширяет свою роль во всевозможных исследовательных направлениях биологического характера, потому актуальность и востребованность знаний по обработке таких данных постоянно растёт. Вдобавок для многих лабораторий именно нанопоровый секвенатор становится первым NGS устройством по причине доступности, а выделить штатного биоинформатика под это возможно далеко не всегда; поскольку секвенирование без обработки данных это почти ничто, а работать нужно — данный курс ориентирован на то, чтобы дать базовые знания о том, как начинать обрабатывать данные с секвенатора самостоятельно, какими путями решать свои задачи и что ещё можно узнать помимо ответов на поставленные вопросы.
Что будет в программе
Прикладной курс ориентирован на людей, с минимальным или отсутствующим опытом в обработке данных нанопорового секвенирования и самом секвенировании, но заинтересованными как в обработке таких данных, так и просто в секвенировании.
Бейзколлинг и QC
Преобразование сырого сигнала в нуклеотиды в разных режимах и базовый контроль качества
Выравнивание на геном и генотипирование
Классический картировщик minimap2 и официальный medaka как детектор вариантов
Сборка de novo и полировка
Ассеблер Flye для примере бактерииального генома с контролем при помощи Bandage и использование «полировки» для коррекции ошибок
Классификация прочтений
Использование инструмента kraken2 для метагеномных задач
Продвинутые манипуляции с сырыми данными
Детекция метилирования, дуплексный бейзколлинг и фильтрация сырых данных
Свободные вопросы по биоинформатике
Возможность задать дополнительные вопросы как по теме занятия, так и касающиеся чисто вашего направления исследований

Для чего нужен этот курс

Курс необходим для тех, кому необходимо работать с нанопоровым секвенированием, особенно тогда, когда секвенатор есть, а биоинформатика нет.

Аудитория курса
  • Аспиранты и молодые учёные
  • Сотрудники технологических и коммерческих компаний
  • Микробиологи, специалисты КДЛ
    и смежных областей
Программа курса
Перечень навыков и знаний, которые желательны при прохождении курса
По окончании курса вы сможете:

Преобразовывать данные сигнала нанопорового секвенирования в подготовленные для последующих шагов прочтения

Картировать длинные прочтения на референс
Оценивать наличие генетических вариантов при помощи длинных прочтений
Решать задачи метагеномики при помощи нанопорового секвенирования
Выполнять базовую сборку генома de novo из длинных прочтений и пытаться её улучшать

Составлять сложные сценарии обработки и фильтрации данных нанопорового секвенирования

Изучать модификации ДНК при помощи нанопорового секвенирования
Что вы получите по итогам курса
  1. Удостоверение о повышении квалификации;
  2. Доступ к записям занятий на один год;
  3. Практическое руководство по анализу данных;
Что вы получите по итогам курса
  1. Удостоверение о повышении квалификации
  2. Доступ к записям занятий на один год
  3. Практическое руководство по анализу данных
Только при наличии диплома о высшем образовании. Выдаётся по факту прохождения итогового тестирования.

С лицензией на образовательную деятельность можно ознакомиться здесь.
Сергей Евфратов
Курс читают
Стоимость курса
Для физических лиц
Есть беспроцентная рассрочка от Т-Банк
45000
р.
Записаться
Для юридических лиц
50000
р.
Записаться

Введите ваш промокод

  1. Прослушивание курса требует стабильного интернет-соединения, достаточного для просмотра видеотрансляций.
  2. Выполнение практической части подразумевает наличие полноценного компьютера, поддержка полноценной возможности выполнения практической части в RStudio Server и IGV на мобильном устройстве не может быть гарантирована.

Записаться на курс
для прохождения курса вам необходимо заполнить заявку на участие,
с вами свяжется менеджер
Ваша специализация
Заполняя форму, вы принимаете условия договора оферты и даете
согласие на обработку своих персональных данных в соответствии с политикой конфиденциальности
Остались вопросы?
Оставьте контакты и мы вам перезвоним. Или свяжитесь с нами по тел:
+7 (495) 135 12 40. Остались вопросы: biomedschool@pcr.news
Заполняя форму, вы принимаете условия договора оферты и даете
согласие на обработку своих персональных данных в соответствии с политикой конфиденциальности
Организаторы курса:
При информационной поддержке:
Политика в отношении обработки персональных данных
Согласие на обработку персональных данных
Условия оплаты и возврата
Договор
Акционерное общество «Сайенс Медиа Проджектс»
Юр.адрес: 129085, г.Москва, вн.тер.г. муниципальный округ Останкинский, ул. Годовикова, д. 9, стр. 9, этаж 2, пом./ком. I/5
ОГРН: 1187746923220 ИНН: 7702451857 КПП: 771701001